Quando in una centrale termica sono presenti più generatori che coprono gli stessi servizi, il loro funzionamento di default è per priorità. Ovvero si attiva per primo il generatore prioritario e, quindi, a seguire gli altri, se questo è necessario per esigenze di copertura del fabbisogno. Se, tuttavia, il primo generatore è già in grado di coprire interamente il fabbisogno, gli altri generatori rimarranno spenti e pertanto, in fase di esportazione, non si avranno i relativi dati. Se la situazione da modellare è effettivamente questa, ovvero funzionamento con priorità e alcuni generatori spenti, per procedere con la registrazione dell'APE occorre cancellare i generatori spenti e, quindi, riportare nelle note del certificato quanto fatto e una descrizione della situazione.
Le priorità dei generatori viene stabilita semplicemente dall'ordine in cui essi sono inseriti nella centrale termica, dall'alto verso il basso:
Quando i generatori sono di tipologie differenti (ad esempio pompe di calore e caldaie) il funzionamento può avvenire solo per priorità.
Nel caso dei generatori a combustione, invece, è possibile anche impostare una ripartizione uniforme (ovviamente se questa è la situazione reale). A tal proposito è sufficiente agire sulla relativa impostazione dei dati tecnici di tutti i generatori coinvolti:
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